Clank in Space! está construido en el mismo sistema de juego que Clank !: Ack-Building Adventure, con jugadores construyendo un mazo de cartas personal durante el transcurso del juego, con las cartas que les permiten moverse a través de la nave espacial, atacar cosas, adquirir nuevas cartas, y, oh sí, hacer ruido para atraer a Lord Eradikus y sellar potencialmente su propio destino.